MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC02

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019894	TCGA	2	8	27	34	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019894	CCG	2	6	47	52	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019894	CGAG	2	8	1001	1008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019894	TC	3	6	1023	1028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019894	CGG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019894	GA	3	6	1048	1053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019894	CTGGC	2	10	1436	1445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019894	CT	3	6	1479	1484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019894	CAC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019894	GGCC	2	8	1510	1517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019894	GGC	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019894	CAG	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019894	GGT	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019894	TCGC	2	8	2092	2099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019894	TCGT	2	8	2242	2249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019894	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019894	CGTG	2	8	2392	2399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019894	CTT	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019894	GAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019894	CCA	2	6	2467	2472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019894	AACC	2	8	2478	2485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019894	GGA	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019894	GCC	2	6	2741	2746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019894	GCTGG	2	10	2750	2759	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019894	CGA	2	6	2797	2802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019894	CGA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019894	GCTG	2	8	2873	2880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019894	GCCG	2	8	2917	2924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019894	CAA	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019894	TC	3	6	4156	4161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019894	CTC	3	9	4623	4631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019894	CG	3	6	4651	4656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019894	CAG	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019894	GGCC	2	8	4685	4692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019894	GA	3	6	4703	4708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019894	GAA	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019894	GCCCG	2	10	5194	5203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_019894	CGGGG	2	10	5514	5523	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019894	CT	3	6	5541	5546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019894	CGGA	2	8	5850	5857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019894	TG	3	6	5898	5903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019894	TG	3	6	5975	5980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019894	CCT	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019894	CCCA	2	8	7197	7204	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_019894	CTC	2	6	7839	7844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019894	T	6	6	7881	7886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019894	GGA	2	6	7896	7901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019894	ACCTC	2	10	8358	8367	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_019894	GGTCA	2	10	8577	8586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019894	GACG	2	8	8616	8623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019894	CCT	2	6	9085	9090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019894	CCCCT	2	10	9105	9114	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_019894	GTCTG	2	10	9116	9125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019894	CGA	2	6	9135	9140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019894	GCC	2	6	9311	9316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019894	TGC	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019894	CGC	2	6	10168	10173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019894	TTC	2	6	10181	10186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019894	TTG	2	6	10223	10228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019894	CAC	2	6	10236	10241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019894	AGGG	2	8	10253	10260	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019894	GAAT	2	8	12693	12700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019894	GAA	2	6	12719	12724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019894	GCCG	2	8	13440	13447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019894	CG	3	6	13450	13455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019894	TCC	2	6	14184	14189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019894	CAC	2	6	14222	14227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019894	ATCG	2	8	14286	14293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019894	GCT	2	6	14299	14304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019894	ACC	2	6	14377	14382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019894	AGG	2	6	14397	14402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019894	CGG	3	9	14404	14412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019894	CTC	2	6	15009	15014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019894	CGC	2	6	15034	15039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019894	CCT	2	6	15142	15147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_019894	GTCTT	2	10	15212	15221	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019894	CT	3	6	15287	15292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019894	ATTG	2	8	15332	15339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019894	TGC	2	6	15340	15345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019894	ATC	2	6	15371	15376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019894	TGG	2	6	16573	16578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019894	ATG	2	6	16604	16609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019894	ATG	2	6	16702	16707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019894	GCC	2	6	16823	16828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_019894	GCCT	2	8	16831	16838	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019894	TCA	2	6	16855	16860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019894	CGC	2	6	17044	17049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019894	AAT	2	6	17067	17072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019894	AAT	2	6	17088	17093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019894	AC	3	6	18695	18700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019894	CGT	2	6	21453	21458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019894	GTC	2	6	21478	21483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019894	CAG	2	6	22212	22217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019894	GT	3	6	22252	22257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019894	TCG	2	6	22258	22263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019894	CGA	2	6	22276	22281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019894	TCG	2	6	22291	22296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019894	TCG	2	6	22558	22563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019894	GTC	2	6	22812	22817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019894	GGT	2	6	22833	22838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019894	GCC	2	6	23769	23774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019894	CG	3	6	23793	23798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019894	TGG	2	6	23823	23828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019894	TCG	2	6	23875	23880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019894	CGGT	2	8	23917	23924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019894	TCGA	2	8	23931	23938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019894	A	7	7	24201	24207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019894	GAG	2	6	24415	24420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019894	TGG	2	6	27318	27323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019894	A	6	6	27616	27621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019894	GCC	2	6	27622	27627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019894	AAC	2	6	27646	27651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019894	CGG	2	6	27684	27689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019894	AGC	2	6	27703	27708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019894	TCCC	2	8	28312	28319	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_019894	GCG	2	6	28393	28398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019894	CCT	2	6	28508	28513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019894	ATG	2	6	28632	28637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019894	CCG	2	6	28692	28697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019894	TCG	2	6	28740	28745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019894	GGC	2	6	29108	29113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019894	CAA	2	6	29562	29567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019894	TCT	2	6	29573	29578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019894	GTC	2	6	29627	29632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019894	GGT	2	6	29841	29846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019894	TGCCC	2	10	29886	29895	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_019894	TCA	2	6	29898	29903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019894	A	7	7	29945	29951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019894	C	6	6	29987	29992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_019894	CG	3	6	30019	30024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019894	CTTT	2	8	30029	30036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019894	CG	3	6	35346	35351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019894	TTC	3	9	35382	35390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019894	CGA	2	6	35419	35424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019894	GTCA	2	8	35440	35447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019894	ATCGGT	2	12	35512	35523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_019894	GGT	2	6	35533	35538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019894	CTT	2	6	35547	35552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019894	CCGGC	2	10	35554	35563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_019894	AAC	2	6	35596	35601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019894	CGG	2	6	35602	35607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019894	CCAT	2	8	35689	35696	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019894	G	6	6	35731	35736	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019894	CTTGC	2	10	35762	35771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_019894	TTC	2	6	35810	35815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019894	TC	3	6	35819	35824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019894	CCGG	2	8	36758	36765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019894	GA	3	6	37470	37475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019894	C	6	6	37494	37499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NC_019894	CAC	2	6	37570	37575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_019894	AAT	2	6	37596	37601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019894	C	6	6	37635	37640	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
153	NC_019894	G	6	6	37643	37648	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019894	CTCG	2	8	37736	37743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_019894	TTGT	2	8	38141	38148	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019894	ACC	2	6	38188	38193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_019894	CCG	2	6	38594	38599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_019894	GACC	2	8	38603	38610	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.